병무행정사무원은 병무청공무원, 병무담당공무원으로도 불리며 병역법에 의거하여 징·소집 대상, 병역대체복무자, 병력동원대상 등 병역자원을 관리한다. 징병검사 및 각종 병역 관련 업무를 처분하며 향토예비군을 편성하고 예비군 자원을 관리한다. 동원지정 예비군을 관리하고 대상 예비군에 대하여 전시병력 동원 및 훈련소집하며 산업기능요원 채용업체를 지정하고 관리하는 등 병역대체복무자를 편성·관리한다. 병역의무자의 국외여행 및 국외체제 시의 허가 및 병적증명서, 복무확인서 발급 등의 업무를 수행하고 훈련 불참 등 병역법 위반 시 고발 등의 조치를 하기도 한다.
병무행정은 국가가 담당하므로 병무행정사무원이 되려면 9급 국가직 공무원 시험에 합격해야 한다. 병무청 공무원으로 임용되면 기관별 결원, 본인 희망 등을 고려하여 배치되며 병무청 본부 및 지방청에서 근무한다.병무행정사무원은 전국단위의 일반행정 행정직 공무원에 합격한 후, 병무청에 지원 하여 근무할 수 있으며 현재는 모두 지방직이 아닌 국가직 공무원으로서 대부분 정년까지 근무하는 편이다.