보세사는 무역과 관련된 국가전문자격증으로 보세창고운영인이 보세창고를 운영하거나, 지정보세구역의 화물관리인이나 특허보세구역의 운영인이 자신의 보세구역을 세관에서 자율관리보세구역으로 지정받기 위해서 반드시 채용하여야하는 전문화물관리인이다. 보세사는 보세화물관리에 관한 지식으로 보세화물관리에 대한 세관공무원의 업무 중 일부를 위탁받아 수행하는 업무를 담당하며 한국관세물류협회에서 시행하는 시험을 통해 자격증을 취득할 수 있다.

시험과목은 모두 5과목이며 객관식 5지 선다형으로 시행된다. 과목당 25문제씩으로 총 125문항이 출제된다. ① '수출입통관절차' 과목에서는 관세법 일반과 수출입통관절차 전반에 대한 내용이, ② '보세구역관리' 과목에서는 보세구역관리에 대한 전반적인 내용이 출제되며, ③ '화물관리' 과목에서는 보세화물관리 전반, 수출입환적화물관리, 보세운송제도 전반, 관세법상 운송수단, 화물운송주선업자 포함 내용이 출제된다. ④ '수출입안전관리'에서는 관세국경감시제도, AEO제도가 출제되며 ⑤ '자율관리 및 관세벌칙' 과목에서는 자율관리보세구역제도 전반과 보세사 제도, 자유무역지역제도, 관세법상 벌칙 및 조사와 처분에 대한 문항들이 출제된다. 4과목의 AEO는 수출입안전관리우수공인업체를 말하며, 관세청 '수출입 안전관리 우수업체 신청을 위한 가이드라인'은 제외된다. 보세사 한 문제당 배점은 4점씩이며, 과목당 100점 만점을 기준으로 하여 전체 평균 점수가 60점 이상 되고 과목별 점수가 40점 이상 되어야 합격하게 된다.