1. 나무도 엄마가 있을까? - 6
2. 스테이크를 좋아하는 나무 - 12
3. 외계인을 사로잡은 동그란 물결 - 18
4. 아주 특별한 겨울 외투 - 24
5. 보이지 않지만 힘이 세요! - 30
6. 날 우습게 보지 마! - 36
7. 줄기 속에서 무슨 일이? - 42
8. 초록 잎에서 일어난 기막힌 사건 - 48
9. 아기 때 얼굴 기억하기 - 43
10. 날 이상하게 보지 말아 줘 - 60
11. 나를 보호해 줘요 - 66
12. 친하게 지내요 - 72
13. 바람아 불어다오 - 78
14. 똥을 지켜라! - 84
15. 감자의 정체를 밝혀라! - 90
16. 다리가 없는데 움직인다고? - 96
17. 앗, 적이 나타났다! - 102
18. 우리에게도 시계가 있다고! - 108
19. 떨어져도 괜찮아 - 114
20. 초록 마을 만세! 120

『왜 양파를 까면 눈물이 날까』는 교과서 개념을 잡는 20가지 식물 이야기를 담고 있다. '벌레를 잡아먹는 식물이 있나요?', '숨만 쉬어도 지구가 살아난다고요?' 등 무심코 지나쳤던 식물과 관련된 다양한 이야기를 통해 아이들은 생각을 키우고 과학의 기초 개념을 잡을 수 있다.